Генетичен панел, екзом или цял геном: каква е разликата и кой тест е подходящ?
Понякога човек преминава през множество прегледи и изследвания, но причината за симптомите му остава неясна. В други случаи няколко членове на едно семейство имат сходни заболявания и възниква въпросът дали зад тях не стои наследствена промяна.
Генетичното изследване може да помогне в търсенето на отговор, но не всеки тест разглежда една и съща част от наследствената информация. Генният панел, екзомното секвениране и цялостното геномно секвениране се различават най-вече по обхвата си.
Ако си представим човешката ДНК като огромна библиотека, генният панел проверява определен рафт, екзомното секвениране разглежда всички части от книгите, които съдържат основните инструкции, а цялостното геномно секвениране анализира почти цялата библиотека.
Какво представлява генният панел?
Генният панел изследва предварително подбрана група гени, за които е известно, че са свързани с конкретно заболяване или определен тип симптоми. Например при съмнение за наследствено сърдечно заболяване панелът може да включва гени, свързани с кардиомиопатии или нарушения на сърдечния ритъм. При фамилна обремененост за някои онкологични заболявания се изследва друга група гени. Този подход е подходящ, когато лекарят има сравнително ясна диагностична насока. Основните му предимства са, че анализът е фокусиран, обикновено се интерпретира по-бързо и намалява вероятността да бъдат открити промени, които нямат отношение към конкретния здравословен проблем.
Ограничението е, че тестът не разглежда останалите гени. Ако причината за симптомите е свързана с ген, който не е включен в панела, тя може да остане неоткрита.
Какво е екзомно секвениране?
Whole Exome Sequencing (WES), или цялостно екзомно секвениране, анализира екзоните – частите от гените, които съдържат инструкции за създаването на белтъци.
Екзомът представлява едва около 1-2% от човешкия геном, но именно в тези кодиращи области се намират голяма част от познатите промени, причиняващи редки наследствени заболявания.
WES може да бъде препоръчано, когато:
- симптомите могат да бъдат свързани с различни гени;
- стандартните генетични панели не са дали отговор;
- заболяването е сложно или се проявява по нетипичен начин;
- има съмнение за рядко генетично състояние без ясна диагноза.
Предимството на екзомното секвениране е, че едновременно се разглеждат кодиращите части на хиляди гени. Това увеличава вероятността да бъде намерена генетична причина, без да се налага последователно назначаване на множество отделни панели. WES обаче не анализира пълноценно некодиращите области между и около гените. То може да пропусне и някои по-сложни структурни промени в ДНК, в зависимост от използваната технология и начина на анализ.
Какво представлява цялостното геномно секвениране ?
Whole Genome Sequencing (WGS), или цялостно геномно секвениране, разглежда най-широк обхват от наследствената информация. То включва както гените, така и голяма част от некодиращите и регулаторните области на ДНК. Тези зони не създават директно белтъци, но могат да влияят върху това кога, къде и колко активно работят определени гени. WGS може да открива и промени, които биха останали извън обхвата на генния панел или екзомното секвениране.
Този метод може да бъде особено полезен при сложни случаи, при дългогодишно търсене на диагноза или когато по-ограничените изследвания не са установили причината. Екзомното и геномното секвениране често се използват именно когато единичен ген или генен панел не е дал убедителен резултат или когато предполагаемата генетична причина не е ясна.
По-големият обхват обаче не означава автоматично, че WGS винаги е най-добрият първи избор. Изследването генерира огромно количество информация, а част от откритите промени все още не могат да бъдат категорично свързани със заболяване.
Повече информация не винаги означава по-ясен отговор
При по-широките изследвания могат да бъдат открити хиляди генетични разлики. Повечето са нормална част от индивидуалните особености и не причиняват заболяване.
Резултатът може да покаже:
- патогенен или вероятно патогенен вариант - промяна, за която има достатъчно доказателства, че е свързана със заболяване;
- вариант с неясно клинично значение - промяна, за която науката все още не разполага с достатъчно информация;
- отрицателен резултат - не е открита убедителна генетична причина с използвания метод.
Отрицателният резултат не винаги изключва наследствено заболяване. Възможно е промяната да не се открива с конкретната технология, да се намира в неизследвана област или все още да не е позната на медицината.
При WES и WGS понякога се откриват и т.нар. вторични находки – генетични промени, които не са свързани с първоначалната причина за изследването, но могат да показват риск от друго заболяване.
Защо е важна генетичната консултация?
Изборът между генен панел, WES и WGS трябва да се основава на симптомите, личната и семейната медицинска история, предишните изследвания и конкретния диагностичен въпрос.
Генетичният специалист може да прецени:
- кой тест има най-голяма вероятност да даде полезен отговор;
- дали е необходимо да бъдат изследвани и родителите или други роднини;
- какво означава резултатът за пациента и неговото семейство;
- дали находката променя проследяването, профилактиката или лечението.
Понякога най-правилният избор е ограничен и целенасочен панел. В други случаи по-информативно може да бъде екзомното или цялостното геномно секвениране. Най-широкото изследване не е непременно най-подходящото за всеки човек.
Затова генетичният тест не трябва да се избира само според броя на анализираните гени. Най-важният въпрос е каква медицинска информация търсим и как полученият резултат ще бъде използван в грижата за пациента.
CredoWeb е социална платформа, която свързва всички участници в здравеопазването, предоставяйки възможности за интерактивна комуникация между лекари, фармацевти, институции, компании и като цяло всички, за които здравето е качество на живот.
CredoWeb е вашият източник на експертна информация в сферата на здравеопазването!
